Updated HPC scripts.

tools/HPC scripts/gprmax_omp_mpi.sh

@@ -0,0 +1,37 @@
+#!/bin/sh
+#####################################################################################
+### Change to current working directory:
+#$ -cwd
+
+### Specify runtime (hh:mm:ss):
+#$ -l h_rt=01:00:00
+
+### Email options:
+#$ -m ea -M joe.bloggs@email.com
+
+### Resource reservation:
+#$ -R y
+
+### Parallel environment ($NSLOTS):
+#$ -pe mpi 800
+
+### Job script name:
+#$ -N gprmax_omp_mpi.sh
+#####################################################################################
+
+### Initialise environment module
+. /etc/profile.d/modules.sh
+
+### Load Anaconda environment for gprMax, i.e. Python 3 and required packages
+module load anaconda
+source activate gprMax
+
+### Load OpenMPI
+module load openmpi-gcc
+
+### Set number of OpenMP threads
+export OMP_NUM_THREADS=8
+
+### Run gprMax with input file
+cd $HOME/gprMax
+mpirun -np $NSLOTS python -m gprMax mymodel.in -n 100 -mpi